MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Acidithiobacillus caldus SM-1 chromosome

Total Repeats: 54270

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_015850	GCG	2	6	22812	22817	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780762
502	NC_015850	TGCCC	2	10	22944	22953	0 %	20 %	20 %	60 %	340780762
503	NC_015850	GCC	2	6	22962	22967	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780762
504	NC_015850	GAC	2	6	22984	22989	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780762
505	NC_015850	TGG	2	6	23000	23005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780762
506	NC_015850	GCC	2	6	23027	23032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780762
507	NC_015850	ACG	2	6	23049	23054	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780762
508	NC_015850	TGC	2	6	23078	23083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780762
509	NC_015850	TGG	2	6	23126	23131	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780762
510	NC_015850	GCCCA	2	10	23218	23227	20 %	0 %	20 %	60 %	340780762
511	NC_015850	CGA	2	6	23235	23240	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780762
512	NC_015850	GC	3	6	23265	23270	0 %	0 %	50 %	50 %	340780762
513	NC_015850	CGAG	2	8	23283	23290	25 %	0 %	50 %	25 %	340780762
514	NC_015850	GC	3	6	23311	23316	0 %	0 %	50 %	50 %	340780762
515	NC_015850	CCG	2	6	23339	23344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780762
516	NC_015850	TGCGC	2	10	23400	23409	0 %	20 %	40 %	40 %	340780762
517	NC_015850	GGA	3	9	23430	23438	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780762
518	NC_015850	GGCC	2	8	23683	23690	0 %	0 %	50 %	50 %	340780763
519	NC_015850	CGA	2	6	23719	23724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780763
520	NC_015850	CGA	2	6	23761	23766	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780763
521	NC_015850	CGT	2	6	23779	23784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780763
522	NC_015850	CT	3	6	23891	23896	0 %	50 %	0 %	50 %	340780763
523	NC_015850	GGCG	2	8	23938	23945	0 %	0 %	75 %	25 %	340780763
524	NC_015850	GTG	2	6	23985	23990	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780763
525	NC_015850	GCGT	2	8	23991	23998	0 %	25 %	50 %	25 %	340780763
526	NC_015850	GAT	2	6	24156	24161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	340780764
527	NC_015850	CGT	2	6	24162	24167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780764
528	NC_015850	CCT	2	6	24227	24232	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780764
529	NC_015850	CAG	2	6	24255	24260	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780764
530	NC_015850	GC	3	6	24377	24382	0 %	0 %	50 %	50 %	340780764
531	NC_015850	C	6	6	24429	24434	0 %	0 %	0 %	100 %	340780764
532	NC_015850	CTGC	2	8	24452	24459	0 %	25 %	25 %	50 %	340780764
533	NC_015850	CG	3	6	24485	24490	0 %	0 %	50 %	50 %	340780764
534	NC_015850	GC	3	6	24593	24598	0 %	0 %	50 %	50 %	340780765
535	NC_015850	GC	3	6	24618	24623	0 %	0 %	50 %	50 %	340780765
536	NC_015850	GGC	3	9	24733	24741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780766
537	NC_015850	CTC	2	6	24770	24775	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	340780766
538	NC_015850	GC	3	6	24886	24891	0 %	0 %	50 %	50 %	340780766
539	NC_015850	CCG	2	6	24928	24933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780766
540	NC_015850	CGG	2	6	24942	24947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780766
541	NC_015850	GCT	2	6	25003	25008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780766
542	NC_015850	TCT	2	6	25054	25059	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	340780766
543	NC_015850	GCG	2	6	25065	25070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780766
544	NC_015850	GTG	2	6	25124	25129	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780766
545	NC_015850	CAC	2	6	25132	25137	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780766
546	NC_015850	GGT	2	6	25151	25156	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780766
547	NC_015850	CGG	3	9	25182	25190	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780766
548	NC_015850	CCG	2	6	25205	25210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780766
549	NC_015850	CGC	2	6	25278	25283	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780766
550	NC_015850	GCA	2	6	25296	25301	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780766
551	NC_015850	CGC	2	6	25341	25346	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780766
552	NC_015850	TCCT	2	8	25355	25362	0 %	50 %	0 %	50 %	340780766
553	NC_015850	GTG	2	6	25373	25378	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780766
554	NC_015850	GGC	2	6	25466	25471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780766
555	NC_015850	TTCA	2	8	25472	25479	25 %	50 %	0 %	25 %	340780766
556	NC_015850	CCA	2	6	25546	25551	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780766
557	NC_015850	AGG	2	6	25632	25637	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780766
558	NC_015850	GGC	2	6	25666	25671	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780766
559	NC_015850	CTG	2	6	25676	25681	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780766
560	NC_015850	CG	3	6	25719	25724	0 %	0 %	50 %	50 %	340780766
561	NC_015850	CAC	2	6	25789	25794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780766
562	NC_015850	GAG	2	6	25802	25807	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780766
563	NC_015850	GCG	2	6	25857	25862	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780766
564	NC_015850	GGTCTG	2	12	26030	26041	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	340780766
565	NC_015850	GAG	2	6	26069	26074	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780766
566	NC_015850	CGAG	2	8	26089	26096	25 %	0 %	50 %	25 %	340780766
567	NC_015850	GGCC	2	8	26110	26117	0 %	0 %	50 %	50 %	340780766
568	NC_015850	CGC	2	6	26230	26235	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780766
569	NC_015850	GTT	2	6	26237	26242	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	340780766
570	NC_015850	TGG	2	6	26247	26252	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780766
571	NC_015850	GGA	2	6	26335	26340	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780766
572	NC_015850	TGC	2	6	26350	26355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780766
573	NC_015850	GC	3	6	26354	26359	0 %	0 %	50 %	50 %	340780766
574	NC_015850	CGG	2	6	26493	26498	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780766
575	NC_015850	CAG	2	6	26598	26603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780767
576	NC_015850	TCG	2	6	26617	26622	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780767
577	NC_015850	CCG	2	6	26638	26643	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780767
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579	NC_015850	CG	3	6	26656	26661	0 %	0 %	50 %	50 %	340780767
580	NC_015850	GCT	2	6	26666	26671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780767
581	NC_015850	TGG	2	6	26743	26748	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780767
582	NC_015850	GCA	2	6	26750	26755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780767
583	NC_015850	TGC	2	6	26776	26781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780767
584	NC_015850	GCG	2	6	26818	26823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780767
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588	NC_015850	GC	3	6	27030	27035	0 %	0 %	50 %	50 %	340780767
589	NC_015850	GGC	2	6	27083	27088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780767
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591	NC_015850	GGC	2	6	27131	27136	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780767
592	NC_015850	AGG	2	6	27206	27211	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780767
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596	NC_015850	CCA	2	6	27434	27439	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	340780768
597	NC_015850	CGG	2	6	27512	27517	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780768
598	NC_015850	CGG	2	6	27520	27525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780768
599	NC_015850	GCG	2	6	27526	27531	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780768
600	NC_015850	ATT	2	6	27650	27655	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	340780768
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607	NC_015850	GCA	2	6	28132	28137	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780769
608	NC_015850	GAA	2	6	28191	28196	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	340780769
609	NC_015850	CGTG	2	8	28253	28260	0 %	25 %	50 %	25 %	340780769
610	NC_015850	GCG	2	6	28298	28303	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780769
611	NC_015850	GCG	2	6	28311	28316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780769
612	NC_015850	GCG	2	6	28360	28365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780769
613	NC_015850	CAG	2	6	28368	28373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	340780769
614	NC_015850	GGA	2	6	28427	28432	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	340780769
615	NC_015850	CGC	2	6	28511	28516	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	340780769
616	NC_015850	GCG	2	6	28576	28581	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780769
617	NC_015850	CGG	2	6	28588	28593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780769
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620	NC_015850	GCCC	2	8	28622	28629	0 %	0 %	25 %	75 %	340780769
621	NC_015850	GC	3	6	28649	28654	0 %	0 %	50 %	50 %	340780769
622	NC_015850	CGG	2	6	28701	28706	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	340780769
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628	NC_015850	TGC	2	6	29056	29061	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	340780770
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633	NC_015850	TGG	2	6	29232	29237	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	340780770
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